Protein–RNA interactions for Protein: P51911

CNN1, Calponin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN1P51911 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNN1P51911 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNN1P51911 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNN1P51911 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNN1P51911 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNN1P51911 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNN1P51911 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN1P51911 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN1P51911 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN1P51911 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms