Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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