Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 LINC00470-201ENST00000412816 2031 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.963e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 LINC00470-207ENST00000581430 556 ntTSL 57.8□□□□□ -1.163e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MDM4-211ENST00000470908 884 ntTSL 513.24□□□□□ -0.296e-11■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MDM4-209ENST00000463049 6102 ntTSL 59.5□□□□□ -0.896e-11■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MDM4-212ENST00000471783 552 ntTSL 38.32□□□□□ -1.086e-11■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.186e-11■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.246e-11■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.276e-11■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.36e-11■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.36e-11■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.356e-11■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.46e-11■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.446e-11■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.756e-11■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DLG1-204ENST00000392381 2833 ntTSL 1 (best)20.71■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-212ENST00000436682 543 ntTSL 214.98□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-207ENST00000419227 1771 ntTSL 214.49□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-209ENST00000419553 582 ntTSL 212.45□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-206ENST00000412364 710 ntTSL 212.22□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 21.9
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TARDBPQ13148 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-205ENST00000392382 2690 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-201ENST00000346964 5034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 ABCA8-201ENST00000269080 5677 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 ABCA8-203ENST00000430352 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-227ENST00000486877 479 ntTSL 28.87□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-219ENST00000456699 629 ntTSL 38.87□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -12e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-223ENST00000471733 2605 ntTSL 1 (best)6.95□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-203ENST00000392380 716 ntTSL 36.3□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 ABCA8-204ENST00000541225 3657 ntTSL 25□□□□□ -1.612e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 DLG1-226ENST00000485409 656 ntTSL 34.74□□□□□ -1.652e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.762e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.373e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 PRELID3A-206ENST00000589565 777 ntTSL 316.42■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.34e-22■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.634e-22■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.213e-30■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.53e-30■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 LDHA-215ENST00000537296 1511 ntTSL 210.76□□□□□ -0.693e-30■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 LDHA-222ENST00000543695 554 ntTSL 510.52□□□□□ -0.733e-30■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 LDHA-207ENST00000460405 680 ntTSL 310.3□□□□□ -0.763e-30■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 LDHA-216ENST00000538451 1345 ntTSL 29.46□□□□□ -0.93e-30■■■■□ 21.9
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TARDBPQ13148 LDHA-220ENST00000542179 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.043e-30■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.163e-30■■■■□ 21.9
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TARDBPQ13148 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.333e-30■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.723e-7■■■■□ 21.9
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TARDBPQ13148 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.463e-7■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.323e-7■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 PDCD6IP-206ENST00000457054 5962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 RPS10-203ENST00000464218 615 ntTSL 512.26□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 RPS10-206ENST00000494077 781 ntTSL 211.59□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 RPS10-204ENST00000467531 777 ntTSL 210.72□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 RPS10-201ENST00000326199 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 RPS10-202ENST00000344700 650 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 INTS1-202ENST00000468115 3051 ntTSL 214.16□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.253e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.663e-7■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 FAM20B-202ENST00000440702 603 ntTSL 317.59■□□□□ 0.413e-7■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.832e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.063e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.053e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-238ENST00000534647 866 ntTSL 511.88□□□□□ -0.511e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-235ENST00000533189 498 ntTSL 311.18□□□□□ -0.621e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.821e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.011e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.051e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.071e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.081e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.081e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.081e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.091e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.091e-8■■■■□ 21.9
TARDBPQ13148 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.11e-8■■■■□ 21.9
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