Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP3BQ9BS92 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms