Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 EEF1AKMT3-202ENST00000333012 2762 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF233-201ENST00000391958 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RANGAP1-207ENST00000455915 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 POLE3-201ENST00000374169 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RPAP3-201ENST00000005386 4370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PAX6-245ENST00000638914 7300 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PPFIBP2-216ENST00000530181 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC61A2-204ENST00000379020 2252 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 GJB2-202ENST00000382848 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PLK4-201ENST00000270861 3841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 STAT1-204ENST00000409465 3097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TULP3-202ENST00000448120 3076 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 NRAP-202ENST00000360478 5426 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 STIP1P3-201ENST00000394563 1624 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD6-213ENST00000520793 2489 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PAPD4-204ENST00000453514 3523 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PRICKLE1-215ENST00000640055 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 IPO5P1-201ENST00000593576 2887 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRR1-207ENST00000621627 2857 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005304.2-201ENST00000580134 1982 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF559-206ENST00000587557 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAJC2-204ENST00000412522 3033 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A11-201ENST00000380056 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms