RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.55■■■□□ 2.48
RPUSD4-208ENST00000533628 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.01■■□□□ 1.91
RPUSD4-208ENST00000533628 ABCC9O60706 1549 aa26.15■■□□□ 1.78
RPUSD4-208ENST00000533628 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
RPUSD4-208ENST00000533628 NACADO15069 1562 aa25.33■■□□□ 1.65
RPUSD4-208ENST00000533628 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.32■■□□□ 1.64
RPUSD4-208ENST00000533628 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.3■■□□□ 1.64
RPUSD4-208ENST00000533628 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.3■■□□□ 1.64
RPUSD4-208ENST00000533628 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.27■■□□□ 1.64
RPUSD4-208ENST00000533628 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.74■■□□□ 1.55
RPUSD4-208ENST00000533628 SCRIBQ14160 1630 aa24.65■■□□□ 1.54
RPUSD4-208ENST00000533628 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.57■■□□□ 1.52
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RPUSD4-208ENST00000533628 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.28■■□□□ 1.48
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RPUSD4-208ENST00000533628 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.83■■□□□ 1.41
RPUSD4-208ENST00000533628 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.78■■□□□ 1.4
RPUSD4-208ENST00000533628 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD4-208ENST00000533628 SMARCA4P51532 1647 aa23.63■■□□□ 1.37
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RPUSD4-208ENST00000533628 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.55■■□□□ 1.36
RPUSD4-208ENST00000533628 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD4-208ENST00000533628 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD4-208ENST00000533628 NCAPD3P42695 1498 aa23.4■■□□□ 1.34
RPUSD4-208ENST00000533628 SMARCA2P51531 1590 aa23.39■■□□□ 1.34
RPUSD4-208ENST00000533628 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
RPUSD4-208ENST00000533628 WIZO95785 1651 aa23.3■■□□□ 1.32
RPUSD4-208ENST00000533628 HMGXB3Q12766 1538 aa23.28■■□□□ 1.32
RPUSD4-208ENST00000533628 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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RPUSD4-208ENST00000533628 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RPUSD4-208ENST00000533628 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.81■■□□□ 1.24
RPUSD4-208ENST00000533628 NESP48681 1621 aa22.74■■□□□ 1.23
RPUSD4-208ENST00000533628 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD4-208ENST00000533628 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD4-208ENST00000533628 CFTRP13569 1480 aa22.65■■□□□ 1.22
RPUSD4-208ENST00000533628 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.52■■□□□ 1.2
RPUSD4-208ENST00000533628 ERCC6Q03468 1493 aa22.47■■□□□ 1.19
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RPUSD4-208ENST00000533628 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.46■■□□□ 1.19
RPUSD4-208ENST00000533628 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.44■■□□□ 1.18
RPUSD4-208ENST00000533628 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.36■■□□□ 1.17
RPUSD4-208ENST00000533628 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
RPUSD4-208ENST00000533628 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.29■■□□□ 1.16
RPUSD4-208ENST00000533628 WDR62O43379 1518 aa22.23■■□□□ 1.15
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RPUSD4-208ENST00000533628 CUX2O14529 1486 aa22.18■■□□□ 1.14
RPUSD4-208ENST00000533628 TOPBP1Q92547 1522 aa22.12■■□□□ 1.13
RPUSD4-208ENST00000533628 ABCC8Q09428 1581 aa22.11■■□□□ 1.13
RPUSD4-208ENST00000533628 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.11■■□□□ 1.13
RPUSD4-208ENST00000533628 CUX1P39880 1505 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD4-208ENST00000533628 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
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RPUSD4-208ENST00000533628 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RPUSD4-208ENST00000533628 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.95■■□□□ 1.1
RPUSD4-208ENST00000533628 TOP2BQ02880 1626 aa21.94■■□□□ 1.1
RPUSD4-208ENST00000533628 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.93■■□□□ 1.1
RPUSD4-208ENST00000533628 IFT140Q96RY7 1462 aa21.9■■□□□ 1.1
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RPUSD4-208ENST00000533628 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.86■■□□□ 1.09
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RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
RPUSD4-208ENST00000533628 WDR97A6NE52 1622 aa21.76■■□□□ 1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.75■■□□□ 1.07
RPUSD4-208ENST00000533628 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.064e-7■■■□□ 18.4
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RPUSD4-208ENST00000533628 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.64■■□□□ 1.06
RPUSD4-208ENST00000533628 TRIM41Q8WV44 630 aa21.64■■□□□ 1.05
RPUSD4-208ENST00000533628 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.62■■□□□ 1.05
RPUSD4-208ENST00000533628 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.61■■□□□ 1.05
RPUSD4-208ENST00000533628 GRIN2BQ13224 1484 aa21.56■■□□□ 1.04
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RPUSD4-208ENST00000533628 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.48■■□□□ 1.03
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RPUSD4-208ENST00000533628 ADAMTS12P58397 1594 aa21.4■■□□□ 1.02
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RPUSD4-208ENST00000533628 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.37■■□□□ 1.01
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RPUSD4-208ENST00000533628 GRIN2AQ12879 1464 aa21.29■■□□□ 1
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RPUSD4-208ENST00000533628 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.29■■□□□ 1
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RPUSD4-208ENST00000533628 PRXQ9BXM0 1461 aa21.22■□□□□ 0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 NUP160Q12769 1436 aa21.21■□□□□ 0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.19■□□□□ 0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 CEP170Q5SW79 1584 aa21.19■□□□□ 0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.19■□□□□ 0.98
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RPUSD4-208ENST00000533628 KIF21BO75037 1637 aa21.06■□□□□ 0.96
RPUSD4-208ENST00000533628 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.06■□□□□ 0.96
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