RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE4D-210ENST00000503258 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.8■□□□□ 0.44
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PDE4D-210ENST00000503258 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.72■□□□□ 0.43
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PDE4D-210ENST00000503258 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.18■□□□□ 0.02
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PDE4D-210ENST00000503258 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
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PDE4D-210ENST00000503258 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
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PDE4D-210ENST00000503258 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.73□□□□□ -0.05
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PDE4D-210ENST00000503258 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4D-210ENST00000503258 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
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PDE4D-210ENST00000503258 GRIN2AQ12879 1464 aa14.54□□□□□ -0.08
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PDE4D-210ENST00000503258 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.44□□□□□ -0.1
PDE4D-210ENST00000503258 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.44□□□□□ -0.1
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PDE4D-210ENST00000503258 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
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PDE4D-210ENST00000503258 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.34□□□□□ -0.11
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