Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ACAD9-204ENST00000505867 2401 ntTSL 214.95□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 ACAD9-207ENST00000511325 1939 ntTSL 214.45□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 ACAD9-205ENST00000508971 1872 ntTSL 513.4□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 XPC-202ENST00000427795 820 ntTSL 211.17□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.789e-13■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.449e-13■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 ACTN1-217ENST00000556203 564 ntTSL 314.58□□□□□ -0.089e-9■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.29e-13■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-207ENST00000535958 568 ntTSL 412.03□□□□□ -0.489e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-208ENST00000536194 581 ntTSL 311□□□□□ -0.659e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-211ENST00000538363 554 ntTSL 210.64□□□□□ -0.719e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 IPO4-220ENST00000561462 1864 ntTSL 216.73■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 BAG6-243ENST00000434444 766 ntTSL 317.09■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 BAG6-251ENST00000452994 880 ntTSL 316.07■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 BAG6-254ENST00000456286 807 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 BAG6-241ENST00000428326 1051 ntTSL 511.96□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 BAG6-242ENST00000433828 902 ntTSL 210.29□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 GLOD4-216ENST00000576670 562 ntTSL 419.52■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 GLOD4-217ENST00000576750 558 ntTSL 412.53□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 GLOD4-207ENST00000574354 558 ntTSL 49.8□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 GLOD4-209ENST00000574581 677 ntTSL 39.32□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 GLOD4-205ENST00000572220 428 ntTSL 57.69□□□□□ -1.183e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 NAP1L1-212ENST00000547993 2481 ntTSL 1 (best)6.44□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 NAP1L1-208ENST00000547529 892 ntTSL 53.65□□□□□ -1.833e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 NAP1L1-225ENST00000552147 1009 ntTSL 53.61□□□□□ -1.833e-7■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.325e-11■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.185e-11■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.265e-11■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 PSME1-209ENST00000561142 865 ntTSL 512.39□□□□□ -0.435e-11■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.755e-11■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 PRPF31-209ENST00000498612 881 ntTSL 517.21■□□□□ 0.351e-8■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 PLXNB2-213ENST00000610984 3443 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.378e-8■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.058e-8■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.168e-8■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SYNGAP1-204ENST00000449372 3930 ntTSL 513.89□□□□□ -0.198e-8■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SYNGAP1-201ENST00000293748 4556 ntTSL 512.44□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SFXN5-220ENST00000490056 906 ntTSL 1 (best)16.43■□□□□ 0.225e-8■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SFXN5-221ENST00000495208 808 ntTSL 1 (best)15.84■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 AP1M1-212ENST00000590945 549 ntTSL 415.66■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 TTC7A-204ENST00000409825 4739 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SS18L1-204ENST00000491916 456 ntTSL 214.67□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 CHID1-224ENST00000534254 1019 ntTSL 512.49□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 CHID1-219ENST00000531859 834 ntTSL 512.35□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 PLOD1-209ENST00000491536 639 ntTSL 310.69□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 ERGIC3-214ENST00000482338 598 ntTSL 28.89□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 LRRC45-205ENST00000583302 1289 ntTSL 217.73■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 TRIO-224ENST00000620511 1547 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 MYBBP1A-211ENST00000574547 1607 ntTSL 1 (best)17.47■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 ABHD16A-206ENST00000474007 506 ntTSL 512.53□□□□□ -0.48e-9■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 ABHD16A-211ENST00000490209 615 ntTSL 29.99□□□□□ -0.814e-8■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 NFKBIA-202ENST00000553342 212 ntTSL 519.7■□□□□ 0.749e-9■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 PPDPF-204ENST00000473620 478 ntTSL 218.23■□□□□ 0.517e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 PPDPF-203ENST00000464438 373 ntTSL 218.1■□□□□ 0.492e-10■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.227e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 ARL8B-205ENST00000455168 1641 ntTSL 217.32■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 RRP7BP-203ENST00000437211 1778 ntTSL 1 (best)19.7■□□□□ 0.749e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.649e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 RRP7BP-204ENST00000458605 2332 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.589e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.88□□□□□ -0.039e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.149e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SGSM3-213ENST00000485962 2973 ntTSL 512.92□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SGSM3-209ENST00000478085 4218 ntTSL 212.06□□□□□ -0.489e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.15e-10■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 PUSL1-203ENST00000467712 877 ntTSL 518.7■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 PUSL1-204ENST00000470520 769 ntTSL 517.68■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 MLF2-205ENST00000537126 851 ntTSL 516.38■□□□□ 0.215e-10■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 MLF2-209ENST00000541346 1234 ntTSL 515.74■□□□□ 0.115e-10■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 PUSL1-202ENST00000463758 940 ntTSL 215.36■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 MLF2-207ENST00000540710 458 ntTSL 311.64□□□□□ -0.555e-10■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 LLGL1-202ENST00000479155 6004 ntTSL 1 (best)15.32■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 USP19-204ENST00000398896 3907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.04□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)18.8■□□□□ 0.69e-9■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 POLG-215ENST00000635986 2351 ntTSL 514.15□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 POLG-211ENST00000532584 708 ntTSL 312.06□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 SMAP2-203ENST00000435168 666 ntTSL 57.01□□□□□ -1.299e-9■■■■■ 37.9
EFTUD2Q15029 LMNA-220ENST00000504687 546 ntTSL 413.48□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.416e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 POLG-222ENST00000637264 3153 ntTSL 511.04□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.915e-8■■■■■ 37.8
EFTUD2Q15029 B4GALT2-205ENST00000481924 1004 ntTSL 28.95□□□□□ -0.982e-20■■■■■ 37.8
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1873.7 ms