RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541346.1

MLF2-209, Transcript of myeloid leukemia factor 2, human

TSL 5

Gene MLF2, Length 1,234 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLF2-209	ENST00000541346	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		42.24	■■■■■ 4.35
MLF2-209	ENST00000541346	ABCC9	O60706	1549 aa		37.95	■■■■□ 3.67
MLF2-209	ENST00000541346	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		37.69	■■■■□ 3.62
MLF2-209	ENST00000541346	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		35.97	■■■■□ 3.35
MLF2-209	ENST00000541346	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		35.93	■■■■□ 3.34
MLF2-209	ENST00000541346	NACAD	O15069	1562 aa		35.72	■■■■□ 3.31
MLF2-209	ENST00000541346	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.6	■■■■□ 3.29
MLF2-209	ENST00000541346	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.46	■■■■□ 3.27
MLF2-209	ENST00000541346	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		35.17	■■■■□ 3.22
MLF2-209	ENST00000541346	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.03	■■■■□ 3.2
MLF2-209	ENST00000541346	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35	■■■■□ 3.19
MLF2-209	ENST00000541346	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.93	■■■■□ 3.18
MLF2-209	ENST00000541346	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.77	■■■■□ 3.16
MLF2-209	ENST00000541346	SCRIB	Q14160	1630 aa		34.57	■■■■□ 3.12
MLF2-209	ENST00000541346	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.36	■■■■□ 3.09
MLF2-209	ENST00000541346	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.15	■■■■□ 3.06
MLF2-209	ENST00000541346	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		34.14	■■■■□ 3.06
MLF2-209	ENST00000541346	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.09	■■■■□ 3.05
MLF2-209	ENST00000541346	NCAPD3	P42695	1498 aa		33.04	■■■□□ 2.88
MLF2-209	ENST00000541346	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		32.99	■■■□□ 2.87
MLF2-209	ENST00000541346	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.9	■■■□□ 2.86
MLF2-209	ENST00000541346	SMARCA2	P51531	1590 aa		32.82	■■■□□ 2.84
MLF2-209	ENST00000541346	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
MLF2-209	ENST00000541346	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.74	■■■□□ 2.83
MLF2-209	ENST00000541346	HMGXB3	Q12766	1538 aa		32.73	■■■□□ 2.83
MLF2-209	ENST00000541346	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
MLF2-209	ENST00000541346	NES	P48681	1621 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MLF2-209	ENST00000541346	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MLF2-209	ENST00000541346	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MLF2-209	ENST00000541346	CUX2	O14529	1486 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MLF2-209	ENST00000541346	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		32.5	■■■□□ 2.79
MLF2-209	ENST00000541346	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MLF2-209	ENST00000541346	WIZ	O95785	1651 aa		32.17	■■■□□ 2.74
MLF2-209	ENST00000541346	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.13	■■■□□ 2.73
MLF2-209	ENST00000541346	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
MLF2-209	ENST00000541346	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MLF2-209	ENST00000541346	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MLF2-209	ENST00000541346	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
MLF2-209	ENST00000541346	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.84	■■■□□ 2.69
MLF2-209	ENST00000541346	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
MLF2-209	ENST00000541346	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.73	■■■□□ 2.67
MLF2-209	ENST00000541346	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.73	■■■□□ 2.67
MLF2-209	ENST00000541346	WDR62	O43379	1518 aa		31.7	■■■□□ 2.67
MLF2-209	ENST00000541346	CFTR	P13569	1480 aa		31.7	■■■□□ 2.66
MLF2-209	ENST00000541346	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.46	■■■□□ 2.63
MLF2-209	ENST00000541346	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
MLF2-209	ENST00000541346	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.32	■■■□□ 2.6
MLF2-209	ENST00000541346	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.2	■■■□□ 2.59
MLF2-209	ENST00000541346	PRDM2	Q13029	1718 aa		31.15	■■■□□ 2.58
MLF2-209	ENST00000541346	TOPBP1	Q92547	1522 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MLF2-209	ENST00000541346	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
MLF2-209	ENST00000541346	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MLF2-209	ENST00000541346	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.97	■■■□□ 2.55
MLF2-209	ENST00000541346	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.96	■■■□□ 2.55
MLF2-209	ENST00000541346	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.86	■■■□□ 2.53	5e-7	■■■■■ 30.2
MLF2-209	ENST00000541346	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.83	■■■□□ 2.53
MLF2-209	ENST00000541346	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	30.81	■■■□□ 2.52
MLF2-209	ENST00000541346	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	30.8	■■■□□ 2.52
MLF2-209	ENST00000541346	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.78	■■■□□ 2.52
MLF2-209	ENST00000541346	FBLN2	P98095	1184 aa		30.76	■■■□□ 2.51
MLF2-209	ENST00000541346	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.76	■■■□□ 2.51
MLF2-209	ENST00000541346	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.72	■■■□□ 2.51
MLF2-209	ENST00000541346	SOGA1	O94964	1423 aa		30.72	■■■□□ 2.51
MLF2-209	ENST00000541346	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		30.67	■■■□□ 2.5
MLF2-209	ENST00000541346	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		30.67	■■■□□ 2.5
MLF2-209	ENST00000541346	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		30.67	■■■□□ 2.5
MLF2-209	ENST00000541346	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.64	■■■□□ 2.5
MLF2-209	ENST00000541346	ARHGEF11	O15085	1522 aa		30.62	■■■□□ 2.49
MLF2-209	ENST00000541346	CUX1	P39880	1505 aa		30.61	■■■□□ 2.49
MLF2-209	ENST00000541346	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.55	■■■□□ 2.48
MLF2-209	ENST00000541346	CHD1	O14646	1710 aa		30.53	■■■□□ 2.48
MLF2-209	ENST00000541346	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.5	■■■□□ 2.47
MLF2-209	ENST00000541346	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	30.47	■■■□□ 2.47
MLF2-209	ENST00000541346	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.39	■■■□□ 2.46
MLF2-209	ENST00000541346	WDR97	A6NE52	1622 aa		30.34	■■■□□ 2.45
MLF2-209	ENST00000541346	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.34	■■■□□ 2.45
MLF2-209	ENST00000541346	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.34	■■■□□ 2.45
MLF2-209	ENST00000541346	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.31	■■■□□ 2.44
MLF2-209	ENST00000541346	SYNJ2	O15056	1496 aa		30.28	■■■□□ 2.44
MLF2-209	ENST00000541346	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.24	■■■□□ 2.43
MLF2-209	ENST00000541346	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.23	■■■□□ 2.43
MLF2-209	ENST00000541346	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.23	■■■□□ 2.43
MLF2-209	ENST00000541346	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	30.21	■■■□□ 2.43
MLF2-209	ENST00000541346	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.2	■■■□□ 2.42
MLF2-209	ENST00000541346	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.15	■■■□□ 2.42
MLF2-209	ENST00000541346	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.14	■■■□□ 2.41
MLF2-209	ENST00000541346	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.06	■■■□□ 2.4
MLF2-209	ENST00000541346	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.01	■■■□□ 2.39
MLF2-209	ENST00000541346	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.99	■■■□□ 2.39
MLF2-209	ENST00000541346	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.94	■■■□□ 2.38
MLF2-209	ENST00000541346	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.92	■■■□□ 2.38
MLF2-209	ENST00000541346	NUP160	Q12769	1436 aa		29.88	■■■□□ 2.37
MLF2-209	ENST00000541346	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.87	■■■□□ 2.37
MLF2-209	ENST00000541346	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.86	■■■□□ 2.37
MLF2-209	ENST00000541346	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.83	■■■□□ 2.37
MLF2-209	ENST00000541346	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.68	■■■□□ 2.34
MLF2-209	ENST00000541346	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
MLF2-209	ENST00000541346	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.64	■■■□□ 2.34
MLF2-209	ENST00000541346	IGF1R	P08069	1367 aa		29.59	■■■□□ 2.33
MLF2-209	ENST00000541346	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.58	■■■□□ 2.33

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