Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms