Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMS2P3Q13401 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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