Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PMS2P3Q13401 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PMS2P3Q13401 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PMS2P3Q13401 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PMS2P3Q13401 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PMS2P3Q13401 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PMS2P3Q13401 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PMS2P3Q13401 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PMS2P3Q13401 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PMS2P3Q13401 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PMS2P3Q13401 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PMS2P3Q13401 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PMS2P3Q13401 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PMS2P3Q13401 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PMS2P3Q13401 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PMS2P3Q13401 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PMS2P3Q13401 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PMS2P3Q13401 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PMS2P3Q13401 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PMS2P3Q13401 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PMS2P3Q13401 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PMS2P3Q13401 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PMS2P3Q13401 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PMS2P3Q13401 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PMS2P3Q13401 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PMS2P3Q13401 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PMS2P3Q13401 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PMS2P3Q13401 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PMS2P3Q13401 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PMS2P3Q13401 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PMS2P3Q13401 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PMS2P3Q13401 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PMS2P3Q13401 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PMS2P3Q13401 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PMS2P3Q13401 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PMS2P3Q13401 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PMS2P3Q13401 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PMS2P3Q13401 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PMS2P3Q13401 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMS2P3Q13401 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMS2P3Q13401 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMS2P3Q13401 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMS2P3Q13401 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMS2P3Q13401 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMS2P3Q13401 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMS2P3Q13401 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PMS2P3Q13401 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PMS2P3Q13401 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PMS2P3Q13401 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMS2P3Q13401 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PMS2P3Q13401 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PMS2P3Q13401 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PMS2P3Q13401 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PMS2P3Q13401 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PMS2P3Q13401 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PMS2P3Q13401 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PMS2P3Q13401 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PMS2P3Q13401 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PMS2P3Q13401 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PMS2P3Q13401 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PMS2P3Q13401 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PMS2P3Q13401 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PMS2P3Q13401 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PMS2P3Q13401 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PMS2P3Q13401 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PMS2P3Q13401 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PMS2P3Q13401 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PMS2P3Q13401 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PMS2P3Q13401 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PMS2P3Q13401 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PMS2P3Q13401 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PMS2P3Q13401 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PMS2P3Q13401 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PMS2P3Q13401 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PMS2P3Q13401 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PMS2P3Q13401 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PMS2P3Q13401 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PMS2P3Q13401 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PMS2P3Q13401 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PMS2P3Q13401 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMS2P3Q13401 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMS2P3Q13401 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMS2P3Q13401 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS2P3Q13401 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMS2P3Q13401 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMS2P3Q13401 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS2P3Q13401 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PMS2P3Q13401 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PMS2P3Q13401 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PMS2P3Q13401 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMS2P3Q13401 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMS2P3Q13401 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMS2P3Q13401 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PMS2P3Q13401 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PMS2P3Q13401 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PMS2P3Q13401 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PMS2P3Q13401 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS2P3Q13401 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS2P3Q13401 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PMS2P3Q13401 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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