Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.185e-6■□□□□ 8.4
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TRA2AQ13595 FGG-203ENST00000404648 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.063e-18■□□□□ 8.2
TRA2AQ13595 FGG-204ENST00000405164 1539 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.23e-18■□□□□ 8.2
TRA2AQ13595 FGG-209ENST00000465913 1573 ntTSL 26.95□□□□□ -1.33e-18■□□□□ 8.2
TRA2AQ13595 TFPI-211ENST00000481132 7690 ntTSL 26.65□□□□□ -1.341e-9■□□□□ 8.2
TRA2AQ13595 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.383e-18■□□□□ 8.2
TRA2AQ13595 FGG-212ENST00000492082 2031 ntTSL 56.23□□□□□ -1.413e-18■□□□□ 8.2
TRA2AQ13595 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.523e-18■□□□□ 8.2
TRA2AQ13595 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.751e-9■□□□□ 8.2
TRA2AQ13595 TFPI-208ENST00000435414 687 ntTSL 53.22□□□□□ -1.891e-9■□□□□ 8.2
TRA2AQ13595 TFPI-212ENST00000481389 599 ntTSL 52.83□□□□□ -1.961e-9■□□□□ 8.2
TRA2AQ13595 SRSF1-206ENST00000583741 1465 ntTSL 520.36■□□□□ 0.855e-10■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.435e-10■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.425e-10■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.235e-10■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.475e-10■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SRSF1-204ENST00000581979 1720 ntTSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.515e-10■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SRSF1-207ENST00000584668 758 ntTSL 38.55□□□□□ -1.045e-10■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.058e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 TRIP10-204ENST00000595319 776 ntTSL 522.66■■□□□ 1.228e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 TRIP10-211ENST00000600491 1493 ntTSL 221.83■■□□□ 1.098e-6■□□□□ 8.1
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