Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB2AP61019 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms