Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAB2AP61019 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB2AP61019 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB2AP61019 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB2AP61019 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB2AP61019 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB2AP61019 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB2AP61019 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB2AP61019 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB2AP61019 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB2AP61019 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB2AP61019 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB2AP61019 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB2AP61019 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB2AP61019 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB2AP61019 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB2AP61019 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB2AP61019 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB2AP61019 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB2AP61019 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB2AP61019 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB2AP61019 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB2AP61019 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB2AP61019 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB2AP61019 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB2AP61019 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB2AP61019 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB2AP61019 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB2AP61019 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB2AP61019 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB2AP61019 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB2AP61019 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB2AP61019 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB2AP61019 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB2AP61019 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB2AP61019 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB2AP61019 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB2AP61019 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB2AP61019 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB2AP61019 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB2AP61019 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB2AP61019 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB2AP61019 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB2AP61019 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB2AP61019 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB2AP61019 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB2AP61019 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB2AP61019 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB2AP61019 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB2AP61019 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB2AP61019 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB2AP61019 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB2AP61019 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB2AP61019 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB2AP61019 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB2AP61019 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB2AP61019 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB2AP61019 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB2AP61019 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB2AP61019 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB2AP61019 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB2AP61019 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB2AP61019 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB2AP61019 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB2AP61019 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB2AP61019 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB2AP61019 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB2AP61019 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB2AP61019 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB2AP61019 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB2AP61019 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB2AP61019 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB2AP61019 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB2AP61019 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB2AP61019 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
RAB2AP61019 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB2AP61019 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB2AP61019 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB2AP61019 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB2AP61019 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB2AP61019 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB2AP61019 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB2AP61019 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB2AP61019 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB2AP61019 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB2AP61019 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB2AP61019 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB2AP61019 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB2AP61019 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB2AP61019 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB2AP61019 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB2AP61019 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB2AP61019 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB2AP61019 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB2AP61019 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB2AP61019 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB2AP61019 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB2AP61019 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB2AP61019 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB2AP61019 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms