Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PLNP26678 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLNP26678 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLNP26678 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLNP26678 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms