Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRRC8EQ6NSJ5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRRC8EQ6NSJ5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms