Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 LETM1-203ENST00000505551 2710 ntTSL 1 (best)14.99□□□□□ -0.015e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.025e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.035e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TRIM25-207ENST00000573108 952 ntTSL 314.83□□□□□ -0.045e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.075e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 CNPY2-209ENST00000551475 674 ntTSL 514.57□□□□□ -0.082e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.095e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 GLYR1-202ENST00000436648 3466 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.185e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 GLYR1-204ENST00000586901 582 ntTSL 313.91□□□□□ -0.185e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FXR1-201ENST00000305586 3277 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.215e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NUP98-211ENST00000483285 545 ntTSL 213.55□□□□□ -0.245e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 RUVBL1-205ENST00000478892 872 ntTSL 313.54□□□□□ -0.245e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 GLYR1-210ENST00000589389 3606 ntTSL 1 (best)13.35□□□□□ -0.275e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FXR1-211ENST00000475315 2341 ntTSL 213.32□□□□□ -0.285e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 CNPY2-205ENST00000547570 624 ntTSL 313.19□□□□□ -0.32e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 RUVBL1-208ENST00000585057 1113 ntTSL 313.17□□□□□ -0.35e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 RUVBL1-203ENST00000472125 913 ntTSL 313.09□□□□□ -0.315e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FXR1-222ENST00000498658 683 ntTSL 213.03□□□□□ -0.325e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.375e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TPR-206ENST00000481347 2727 ntTSL 512.61□□□□□ -0.395e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 GLYR1-205ENST00000587297 688 ntTSL 212.43□□□□□ -0.425e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FXR1-207ENST00000468861 1989 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.435e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 RUVBL1-207ENST00000582176 4062 nt12.2□□□□□ -0.465e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 GLYR1-209ENST00000588732 3527 ntTSL 1 (best)12.03□□□□□ -0.485e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FXR1-203ENST00000445140 2651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.685e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 MYLK-216ENST00000513111 595 ntTSL 510.67□□□□□ -0.75e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.715e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FXR1-216ENST00000482125 739 ntTSL 59.91□□□□□ -0.825e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 SSB-205ENST00000422006 2463 ntTSL 59.81□□□□□ -0.845e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 ZC3H15-202ENST00000421536 1101 ntTSL 29.59□□□□□ -0.875e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.885e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.895e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 FXR1-212ENST00000476672 976 ntTSL 28.95□□□□□ -0.985e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 KARS-208ENST00000566772 644 ntTSL 26.88□□□□□ -1.315e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 ALDH3A2-215ENST00000575384 450 ntTSL 56.47□□□□□ -1.375e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 BPTF-205ENST00000424123 8295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.43□□□□□ -1.385e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 ALDH3A2-211ENST00000573565 577 ntTSL 45.71□□□□□ -1.55e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 DHX9-208ENST00000490519 438 ntTSL 52.01□□□□□ -2.095e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TRIM28-214ENST00000600840 338 ntTSL 210.76□□□□□ -0.697e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 AC007780.1-201ENST00000590353 719 ntTSL 411.47□□□□□ -0.571e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PRKAR1A-213ENST00000588178 583 ntTSL 46.44□□□□□ -1.381e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TPM4-207ENST00000588032 712 ntTSL 312.53□□□□□ -0.48e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.058e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 CHCHD2-202ENST00000473095 694 ntTSL 1 (best)16.42■□□□□ 0.221e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.074e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.284e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.384e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 DDB1-207ENST00000535967 1404 ntTSL 315.66■□□□□ 0.12e-9■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.545e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 MYL6-204ENST00000546630 544 ntTSL 1 (best)18.28■□□□□ 0.522e-22■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 MYL6B-203ENST00000548571 223 ntTSL 410.77□□□□□ -0.692e-22■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PRKAR1A-212ENST00000586541 570 ntTSL 56.49□□□□□ -1.378e-14■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.813e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.763e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.713e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.673e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.63e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.63e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.533e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.423e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.343e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.371e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.015e-11■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PRDX3-203ENST00000494433 2277 ntTSL 1 (best)10.39□□□□□ -0.755e-8■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.81e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PSMD7-206ENST00000568717 1395 ntTSL 224.03■■□□□ 1.441e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 DDX17-210ENST00000497196 856 ntTSL 310.62□□□□□ -0.716e-9■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 USP9X-204ENST00000463829 666 ntTSL 34.59□□□□□ -1.677e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 MDH2-206ENST00000461665 551 ntTSL 27.77□□□□□ -1.174e-9■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.213e-25■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.463e-25■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.011e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.248e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 MYH9-204ENST00000459960 687 ntTSL 213.2□□□□□ -0.31e-10■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.222e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.892e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.152e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PARK7-208ENST00000493373 624 ntTSL 516.01■□□□□ 0.152e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PARK7-202ENST00000377488 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PARK7-209ENST00000493678 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.312e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 PARK7-207ENST00000469225 711 ntTSL 311.58□□□□□ -0.562e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 GSPT1-209ENST00000567631 678 ntTSL 27.14□□□□□ -1.271e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 DARS-209ENST00000478212 892 ntTSL 25.33□□□□□ -1.561e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 HDGF-209ENST00000495212 744 ntTSL 324.69■■□□□ 1.546e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 HDGF-206ENST00000471377 592 ntTSL 311.29□□□□□ -0.66e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NMT1-209ENST00000590114 666 ntTSL 316.18■□□□□ 0.181e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NMT1-203ENST00000585561 807 ntTSL 315.85■□□□□ 0.131e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 NMT1-202ENST00000543908 1066 ntTSL 214.66□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 DDB1-203ENST00000451943 1224 ntTSL 210.48□□□□□ -0.732e-7■■□□□ 11.9
G3BP1Q13283 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.918e-9■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.261e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.141e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SRP54-213ENST00000556994 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SRP54-208ENST00000555557 1949 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 DDB1-216ENST00000539739 1624 ntTSL 519.14■□□□□ 0.651e-9■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 MYH9-207ENST00000473022 400 ntTSL 213.71□□□□□ -0.213e-9■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 PSMD4-205ENST00000445776 703 ntTSL 321.16■□□□□ 0.987e-7■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.737e-7■■□□□ 11.8
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 105.2 ms