Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms