RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277415.15

OLFM1-202, Transcript of olfactomedin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene OLFM1, Length 1,014 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OLFM1-202ENST00000277415 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.52■■■■■ 5.52
OLFM1-202ENST00000277415 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.4■■■■■ 4.7
OLFM1-202ENST00000277415 ABCC9O60706 1549 aa43.82■■■■■ 4.61
OLFM1-202ENST00000277415 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.05■■■■■ 4.32
OLFM1-202ENST00000277415 NACADO15069 1562 aa41.87■■■■■ 4.29
OLFM1-202ENST00000277415 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.48■■■■■ 4.23
OLFM1-202ENST00000277415 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.45■■■■■ 4.23
OLFM1-202ENST00000277415 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
OLFM1-202ENST00000277415 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.05■■■■■ 4.16
OLFM1-202ENST00000277415 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41■■■■■ 4.15
OLFM1-202ENST00000277415 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.77■■■■■ 4.12
OLFM1-202ENST00000277415 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.69■■■■■ 4.11
OLFM1-202ENST00000277415 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.65■■■■■ 4.1
OLFM1-202ENST00000277415 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.44■■■■■ 4.06
OLFM1-202ENST00000277415 SCRIBQ14160 1630 aa40.3■■■■■ 4.04
OLFM1-202ENST00000277415 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
OLFM1-202ENST00000277415 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.67■■■■□ 3.94
OLFM1-202ENST00000277415 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.5■■■■□ 3.91
OLFM1-202ENST00000277415 NCAPD3P42695 1498 aa38.6■■■■□ 3.77
OLFM1-202ENST00000277415 SMARCA4P51532 1647 aa38.56■■■■□ 3.76
OLFM1-202ENST00000277415 SMARCA2P51531 1590 aa38.49■■■■□ 3.75
OLFM1-202ENST00000277415 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
OLFM1-202ENST00000277415 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.47■■■■□ 3.75
OLFM1-202ENST00000277415 HMGXB3Q12766 1538 aa38.39■■■■□ 3.74
OLFM1-202ENST00000277415 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.26■■■■□ 3.72
OLFM1-202ENST00000277415 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
OLFM1-202ENST00000277415 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.08■■■■□ 3.69
OLFM1-202ENST00000277415 ERCC6Q03468 1493 aa37.9■■■■□ 3.66
OLFM1-202ENST00000277415 CUX2O14529 1486 aa37.79■■■■□ 3.64
OLFM1-202ENST00000277415 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.72■■■■□ 3.63
OLFM1-202ENST00000277415 NESP48681 1621 aa37.71■■■■□ 3.63
OLFM1-202ENST00000277415 WIZO95785 1651 aa37.64■■■■□ 3.62
OLFM1-202ENST00000277415 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.46■■■■□ 3.59
OLFM1-202ENST00000277415 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
OLFM1-202ENST00000277415 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.41■■■■□ 3.58
OLFM1-202ENST00000277415 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.58
OLFM1-202ENST00000277415 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.33■■■■□ 3.57
OLFM1-202ENST00000277415 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
OLFM1-202ENST00000277415 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.23■■■■□ 3.55
OLFM1-202ENST00000277415 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.08■■■■□ 3.53
OLFM1-202ENST00000277415 CFTRP13569 1480 aa37.07■■■■□ 3.53
OLFM1-202ENST00000277415 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.01■■■■□ 3.52
OLFM1-202ENST00000277415 WDR62O43379 1518 aa37■■■■□ 3.51
OLFM1-202ENST00000277415 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.97■■■■□ 3.51
OLFM1-202ENST00000277415 PRDM2Q13029 1718 aa36.82■■■■□ 3.49
OLFM1-202ENST00000277415 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.78■■■■□ 3.48
OLFM1-202ENST00000277415 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
OLFM1-202ENST00000277415 ABCC8Q09428 1581 aa36.4■■■■□ 3.42
OLFM1-202ENST00000277415 TOPBP1Q92547 1522 aa36.31■■■■□ 3.4
OLFM1-202ENST00000277415 IFT140Q96RY7 1462 aa36.28■■■■□ 3.4
OLFM1-202ENST00000277415 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.26■■■■□ 3.39
OLFM1-202ENST00000277415 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
OLFM1-202ENST00000277415 OSCARQ8IYS5 282 aa36.03■■■■□ 3.36
OLFM1-202ENST00000277415 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
OLFM1-202ENST00000277415 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
OLFM1-202ENST00000277415 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
OLFM1-202ENST00000277415 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
OLFM1-202ENST00000277415 WDR97A6NE52 1622 aa35.81■■■■□ 3.32
OLFM1-202ENST00000277415 SOGA1O94964 1423 aa35.79■■■■□ 3.32
OLFM1-202ENST00000277415 CUX1P39880 1505 aa35.78■■■■□ 3.32
OLFM1-202ENST00000277415 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.77■■■■□ 3.32
OLFM1-202ENST00000277415 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.77■■■■□ 3.32
OLFM1-202ENST00000277415 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.73■■■■□ 3.31
OLFM1-202ENST00000277415 TRIM41Q8WV44 630 aa35.64■■■■□ 3.3
OLFM1-202ENST00000277415 CHD1O14646 1710 aa35.61■■■■□ 3.29
OLFM1-202ENST00000277415 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
OLFM1-202ENST00000277415 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.51■■■■□ 3.28
OLFM1-202ENST00000277415 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.51■■■■□ 3.28
OLFM1-202ENST00000277415 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.51■■■■□ 3.28
OLFM1-202ENST00000277415 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
OLFM1-202ENST00000277415 GRIN2BQ13224 1484 aa35.49■■■■□ 3.27
OLFM1-202ENST00000277415 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.48■■■■□ 3.27
OLFM1-202ENST00000277415 ARHGEF11O15085 1522 aa35.46■■■■□ 3.27
OLFM1-202ENST00000277415 FBLN2P98095 1184 aa35.45■■■■□ 3.27
OLFM1-202ENST00000277415 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.45■■■■□ 3.27
OLFM1-202ENST00000277415 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.39■■■■□ 3.26
OLFM1-202ENST00000277415 TOP2BQ02880 1626 aa35.39■■■■□ 3.26
OLFM1-202ENST00000277415 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.38■■■■□ 3.25
OLFM1-202ENST00000277415 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.38■■■■□ 3.25
OLFM1-202ENST00000277415 PBRM1Q86U86 1689 aa35.37■■■■□ 3.25
OLFM1-202ENST00000277415 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.35■■■■□ 3.25
OLFM1-202ENST00000277415 SYNJ2O15056 1496 aa35.35■■■■□ 3.25
OLFM1-202ENST00000277415 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
OLFM1-202ENST00000277415 SYNJ1O43426 1573 aa35.31■■■■□ 3.24
OLFM1-202ENST00000277415 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.24■■■■□ 3.23
OLFM1-202ENST00000277415 ARAP1Q96P48 1450 aa35.1■■■■□ 3.21
OLFM1-202ENST00000277415 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.07■■■■□ 3.2
OLFM1-202ENST00000277415 ADAMTS12P58397 1594 aa35.05■■■■□ 3.2
OLFM1-202ENST00000277415 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.05■■■■□ 3.2
OLFM1-202ENST00000277415 GRIN2AQ12879 1464 aa35.02■■■■□ 3.2
OLFM1-202ENST00000277415 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.98■■■■□ 3.19
OLFM1-202ENST00000277415 NUP160Q12769 1436 aa34.89■■■■□ 3.18
OLFM1-202ENST00000277415 CEP170Q5SW79 1584 aa34.83■■■■□ 3.17
OLFM1-202ENST00000277415 SHROOM2Q13796 1616 aa34.73■■■■□ 3.15
OLFM1-202ENST00000277415 KIF27Q86VH2 1401 aa34.7■■■■□ 3.15
OLFM1-202ENST00000277415 CUL7Q14999 1698 aa34.63■■■■□ 3.13
OLFM1-202ENST00000277415 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
OLFM1-202ENST00000277415 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.58■■■■□ 3.13
OLFM1-202ENST00000277415 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.56■■■■□ 3.12
OLFM1-202ENST00000277415 IGF1RP08069 1367 aa34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms