RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561277.5

TSPAN3-210, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,592 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-210ENST00000561277 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.38■■■■■ 5.34
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TSPAN3-210ENST00000561277 SMARCA2P51531 1590 aa37.29■■■■□ 3.56
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TSPAN3-210ENST00000561277 IFT140Q96RY7 1462 aa35.04■■■■□ 3.2
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TSPAN3-210ENST00000561277 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.69■■■■□ 3.14
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TSPAN3-210ENST00000561277 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.41■■■■□ 3.1
TSPAN3-210ENST00000561277 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.41■■■■□ 3.1
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TSPAN3-210ENST00000561277 CUL7Q14999 1698 aa33.82■■■■□ 3.01
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TSPAN3-210ENST00000561277 ARAP1Q96P48 1450 aa33.63■■■□□ 2.97
TSPAN3-210ENST00000561277 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.6■■■□□ 2.97
TSPAN3-210ENST00000561277 SHROOM2Q13796 1616 aa33.56■■■□□ 2.96
TSPAN3-210ENST00000561277 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.53■■■□□ 2.96
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