Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX13Q9Y5W8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX13Q9Y5W8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX13Q9Y5W8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX13Q9Y5W8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX13Q9Y5W8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
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