Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3M1Q9Y2T2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3M1Q9Y2T2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3M1Q9Y2T2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AP3M1Q9Y2T2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms