Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
AP3M1Q9Y2T2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
AP3M1Q9Y2T2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
AP3M1Q9Y2T2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
AP3M1Q9Y2T2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
AP3M1Q9Y2T2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
AP3M1Q9Y2T2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
AP3M1Q9Y2T2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
AP3M1Q9Y2T2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
AP3M1Q9Y2T2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
AP3M1Q9Y2T2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
AP3M1Q9Y2T2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
AP3M1Q9Y2T2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
AP3M1Q9Y2T2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
AP3M1Q9Y2T2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AP3M1Q9Y2T2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AP3M1Q9Y2T2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
AP3M1Q9Y2T2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
AP3M1Q9Y2T2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AP3M1Q9Y2T2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
AP3M1Q9Y2T2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AP3M1Q9Y2T2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AP3M1Q9Y2T2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AP3M1Q9Y2T2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
AP3M1Q9Y2T2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AP3M1Q9Y2T2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AP3M1Q9Y2T2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AP3M1Q9Y2T2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AP3M1Q9Y2T2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AP3M1Q9Y2T2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AP3M1Q9Y2T2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AP3M1Q9Y2T2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AP3M1Q9Y2T2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP3M1Q9Y2T2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AP3M1Q9Y2T2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AP3M1Q9Y2T2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP3M1Q9Y2T2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3M1Q9Y2T2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3M1Q9Y2T2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AP3M1Q9Y2T2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
AP3M1Q9Y2T2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP3M1Q9Y2T2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP3M1Q9Y2T2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP3M1Q9Y2T2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP3M1Q9Y2T2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AP3M1Q9Y2T2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP3M1Q9Y2T2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AP3M1Q9Y2T2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AP3M1Q9Y2T2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP3M1Q9Y2T2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP3M1Q9Y2T2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP3M1Q9Y2T2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AP3M1Q9Y2T2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AP3M1Q9Y2T2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AP3M1Q9Y2T2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AP3M1Q9Y2T2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AP3M1Q9Y2T2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AP3M1Q9Y2T2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AP3M1Q9Y2T2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AP3M1Q9Y2T2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP3M1Q9Y2T2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AP3M1Q9Y2T2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AP3M1Q9Y2T2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AP3M1Q9Y2T2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP3M1Q9Y2T2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP3M1Q9Y2T2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP3M1Q9Y2T2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP3M1Q9Y2T2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP3M1Q9Y2T2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP3M1Q9Y2T2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AP3M1Q9Y2T2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3M1Q9Y2T2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AP3M1Q9Y2T2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AP3M1Q9Y2T2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AP3M1Q9Y2T2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP3M1Q9Y2T2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3M1Q9Y2T2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3M1Q9Y2T2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3M1Q9Y2T2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3M1Q9Y2T2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3M1Q9Y2T2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP3M1Q9Y2T2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP3M1Q9Y2T2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AP3M1Q9Y2T2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3M1Q9Y2T2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP3M1Q9Y2T2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3M1Q9Y2T2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP3M1Q9Y2T2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP3M1Q9Y2T2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP3M1Q9Y2T2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3M1Q9Y2T2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3M1Q9Y2T2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP3M1Q9Y2T2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP3M1Q9Y2T2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3M1Q9Y2T2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3M1Q9Y2T2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP3M1Q9Y2T2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms