Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TVP23BQ9NYZ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TVP23BQ9NYZ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TVP23BQ9NYZ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TVP23BQ9NYZ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TVP23BQ9NYZ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms