Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXD2Q9NVH0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EXD2Q9NVH0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EXD2Q9NVH0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms