Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMBRD1Q9NUN5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMBRD1Q9NUN5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMBRD1Q9NUN5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMBRD1Q9NUN5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LMBRD1Q9NUN5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMBRD1Q9NUN5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms