Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNCQ9H7C4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNCQ9H7C4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNCQ9H7C4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNCQ9H7C4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNCQ9H7C4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms