Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABARAPL3Q9BY60 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABARAPL3Q9BY60 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL3Q9BY60 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABARAPL3Q9BY60 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms