Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS4Q9BT78 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS4Q9BT78 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPS4Q9BT78 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS4Q9BT78 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms