Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 CKB-210ENST00000554989 625 ntTSL 217.67■□□□□ 0.421e-10■■■■■ 40.1
BUD13Q9BRD0 CKB-211ENST00000555039 270 ntTSL 515.58■□□□□ 0.081e-10■■■■■ 40.1
BUD13Q9BRD0 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 40
BUD13Q9BRD0 TBL1XR1-233ENST00000637659 3105 ntTSL 54.86□□□□□ -1.635e-7■■■■■ 40
BUD13Q9BRD0 TBL1XR1-222ENST00000631253 4186 ntTSL 52.57□□□□□ -25e-7■■■■■ 40
BUD13Q9BRD0 TBL1XR1-228ENST00000636864 6888 ntTSL 52.29□□□□□ -2.045e-7■■■■■ 40
BUD13Q9BRD0 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.075e-7■■■■■ 40
BUD13Q9BRD0 CTSB-206ENST00000524500 573 ntTSL 421.73■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 CTSB-233ENST00000534636 633 ntTSL 421.62■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 CTSB-226ENST00000532656 573 ntTSL 420.4■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 CTSB-213ENST00000527215 545 ntTSL 418.53■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 CTSB-210ENST00000526195 560 ntTSL 418.44■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 CTSB-208ENST00000525076 550 ntTSL 518■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 CTSB-230ENST00000534149 524 ntTSL 417.94■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 CTSB-221ENST00000531502 557 ntTSL 417.18■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 CTSB-224ENST00000532392 570 ntTSL 416.45■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 CTSB-231ENST00000534382 764 ntTSL 416.45■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 CTSB-217ENST00000530296 561 ntTSL 416.09■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 CTSB-212ENST00000526645 559 ntTSL 413.18□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 CTSB-205ENST00000505496 540 ntTSL 49.83□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 39.9
BUD13Q9BRD0 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 39.8
BUD13Q9BRD0 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 39.8
BUD13Q9BRD0 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 39.8
BUD13Q9BRD0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.43e-8■■■■■ 39.5
BUD13Q9BRD0 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.063e-8■■■■■ 39.5
BUD13Q9BRD0 SNRNP200-207ENST00000493271 585 ntTSL 313.17□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 39.5
BUD13Q9BRD0 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.96□□□□□ -1.141e-15■■■■■ 39.5
BUD13Q9BRD0 PFKFB4-210ENST00000468162 576 ntTSL 57.34□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 39.4
BUD13Q9BRD0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 39.4
BUD13Q9BRD0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 39.4
BUD13Q9BRD0 CTSB-222ENST00000531551 1855 ntTSL 1 (best)19.18■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 39.4
BUD13Q9BRD0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 39.4
BUD13Q9BRD0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 39.4
BUD13Q9BRD0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 39.4
BUD13Q9BRD0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 39.4
BUD13Q9BRD0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 39.4
BUD13Q9BRD0 CPSF4-210ENST00000469897 689 ntTSL 215.61■□□□□ 0.096e-11■■■■■ 39.2
BUD13Q9BRD0 GAPDH-211ENST00000619601 1086 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-16■■■■■ 39.1
BUD13Q9BRD0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 39
BUD13Q9BRD0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 39
BUD13Q9BRD0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 39
BUD13Q9BRD0 ANGPTL8-202ENST00000587543 432 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 39
BUD13Q9BRD0 COL16A1-215ENST00000488897 2423 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 38.8
BUD13Q9BRD0 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-42■■■■■ 38.8
BUD13Q9BRD0 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.121e-42■■■■■ 38.8
BUD13Q9BRD0 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.171e-42■■■■■ 38.8
BUD13Q9BRD0 SERPINA1-203ENST00000393088 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-42■■■■■ 38.8
BUD13Q9BRD0 SERPINA1-202ENST00000393087 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.391e-42■■■■■ 38.8
BUD13Q9BRD0 SERPINA1-201ENST00000355814 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-42■■■■■ 38.8
BUD13Q9BRD0 SERPINA1-207ENST00000440909 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.651e-42■■■■■ 38.8
BUD13Q9BRD0 SERPINA1-206ENST00000437397 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.711e-42■■■■■ 38.8
BUD13Q9BRD0 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.881e-42■■■■■ 38.8
BUD13Q9BRD0 PFKFB3-213ENST00000487989 661 ntTSL 216.08■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 38.7
BUD13Q9BRD0 NUP188-206ENST00000485158 392 ntTSL 216.45■□□□□ 0.229e-13■■■■■ 38.7
BUD13Q9BRD0 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 316.99■□□□□ 0.314e-10■■■■■ 38.7
BUD13Q9BRD0 SGSM3-205ENST00000462457 881 ntTSL 517.02■□□□□ 0.329e-13■■■■■ 38.6
BUD13Q9BRD0 RXRB-205ENST00000483821 582 ntTSL 214.13□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 38.6
BUD13Q9BRD0 PABPC4-219ENST00000525045 765 ntTSL 216.82■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 38.5
BUD13Q9BRD0 PABPC4-222ENST00000527718 746 ntTSL 56.66□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 38.5
BUD13Q9BRD0 KDM5B-210ENST00000602511 542 ntTSL 58.69□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 38.5
BUD13Q9BRD0 PKM-206ENST00000562784 529 ntTSL 212.51□□□□□ -0.413e-10■■■■■ 38.4
BUD13Q9BRD0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.618e-8■■■■■ 38.3
BUD13Q9BRD0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.148e-8■■■■■ 38.3
BUD13Q9BRD0 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.298e-8■■■■■ 38.3
BUD13Q9BRD0 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.188e-8■■■■■ 38.3
BUD13Q9BRD0 TNS1-214ENST00000479185 2513 ntTSL 513.54□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 38.2
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BUD13Q9BRD0 ATG16L1-207ENST00000417017 684 ntTSL 518.48■□□□□ 0.551e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.151e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.221e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.581e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.621e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 MSL1-208ENST00000581246 583 ntTSL 410.8□□□□□ -0.681e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.691e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.71e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 29.94□□□□□ -0.821e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 ATG16L1-218ENST00000498620 740 ntTSL 59.55□□□□□ -0.882e-19■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 MSL1-209ENST00000582884 580 ntTSL 57.01□□□□□ -1.291e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 MSL1-201ENST00000339569 3424 ntTSL 25.61□□□□□ -1.511e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.691e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 517.26■□□□□ 0.354e-10■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 ESPN-211ENST00000632142 564 ntTSL 222.86■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 ESPN-215ENST00000633651 566 ntTSL 522.86■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 SH3D21-204ENST00000496636 383 ntTSL 311.79□□□□□ -0.525e-9■■■■■ 38.1
BUD13Q9BRD0 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.268e-12■■■■■ 38
BUD13Q9BRD0 CPSF1-203ENST00000527916 506 ntTSL 512.7□□□□□ -0.383e-14■■■■■ 38
BUD13Q9BRD0 SETDB1-213ENST00000498193 3854 ntTSL 28.72□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 38
BUD13Q9BRD0 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 38
BUD13Q9BRD0 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 38
BUD13Q9BRD0 FAM13A-211ENST00000508360 1030 ntTSL 38.37□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 38
BUD13Q9BRD0 ARVCF-207ENST00000473551 2108 ntTSL 220.94■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 38
BUD13Q9BRD0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-16■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 GAPDH-208ENST00000474249 1333 ntTSL 515.94■□□□□ 0.142e-16■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.092e-16■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.142e-16■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.443e-29■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 315.12■□□□□ 0.013e-29■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.283e-29■■■■■ 37.7
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