RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000632142.1

ESPN-211, Transcript of espin, humanhuman

TSL 2

Gene ESPN, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESPN-211ENST00000632142 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.99■■■■■ 5.43
ESPN-211ENST00000632142 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.42■■■■■ 4.54
ESPN-211ENST00000632142 ABCC9O60706 1549 aa42.93■■■■■ 4.46
ESPN-211ENST00000632142 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.13■■■■■ 4.17
ESPN-211ENST00000632142 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.07■■■■■ 4.16
ESPN-211ENST00000632142 NACADO15069 1562 aa41.01■■■■■ 4.16
ESPN-211ENST00000632142 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.73■■■■■ 4.11
ESPN-211ENST00000632142 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
ESPN-211ENST00000632142 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.47■■■■■ 4.07
ESPN-211ENST00000632142 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.23■■■■■ 4.03
ESPN-211ENST00000632142 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.05■■■■■ 4
ESPN-211ENST00000632142 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.96■■■■□ 3.99
ESPN-211ENST00000632142 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.9■■■■□ 3.98
ESPN-211ENST00000632142 SCRIBQ14160 1630 aa39.69■■■■□ 3.94
ESPN-211ENST00000632142 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.37■■■■□ 3.89
ESPN-211ENST00000632142 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
ESPN-211ENST00000632142 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.76■■■■□ 3.8
ESPN-211ENST00000632142 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.59■■■■□ 3.77
ESPN-211ENST00000632142 NCAPD3P42695 1498 aa37.98■■■■□ 3.67
ESPN-211ENST00000632142 SMARCA4P51532 1647 aa37.96■■■■□ 3.67
ESPN-211ENST00000632142 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.95■■■■□ 3.67
ESPN-211ENST00000632142 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
ESPN-211ENST00000632142 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.77■■■■□ 3.64
ESPN-211ENST00000632142 SMARCA2P51531 1590 aa37.75■■■■□ 3.63
ESPN-211ENST00000632142 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.63■■■■□ 3.62
ESPN-211ENST00000632142 HMGXB3Q12766 1538 aa37.61■■■■□ 3.61
ESPN-211ENST00000632142 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
ESPN-211ENST00000632142 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
ESPN-211ENST00000632142 WIZO95785 1651 aa37.27■■■■□ 3.56
ESPN-211ENST00000632142 NESP48681 1621 aa37.12■■■■□ 3.53
ESPN-211ENST00000632142 ERCC6Q03468 1493 aa36.92■■■■□ 3.5
ESPN-211ENST00000632142 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.87■■■■□ 3.49
ESPN-211ENST00000632142 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.85■■■■□ 3.49
ESPN-211ENST00000632142 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
ESPN-211ENST00000632142 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.7■■■■□ 3.47
ESPN-211ENST00000632142 CUX2O14529 1486 aa36.64■■■■□ 3.46
ESPN-211ENST00000632142 CFTRP13569 1480 aa36.57■■■■□ 3.45
ESPN-211ENST00000632142 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.55■■■■□ 3.44
ESPN-211ENST00000632142 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.48■■■■□ 3.43
ESPN-211ENST00000632142 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
ESPN-211ENST00000632142 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.37■■■■□ 3.41
ESPN-211ENST00000632142 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.3■■■■□ 3.4
ESPN-211ENST00000632142 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.27■■■■□ 3.4
ESPN-211ENST00000632142 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
ESPN-211ENST00000632142 WDR62O43379 1518 aa36.18■■■■□ 3.38
ESPN-211ENST00000632142 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
ESPN-211ENST00000632142 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.02■■■■□ 3.36
ESPN-211ENST00000632142 PRDM2Q13029 1718 aa35.92■■■■□ 3.34
ESPN-211ENST00000632142 TOPBP1Q92547 1522 aa35.75■■■■□ 3.31
ESPN-211ENST00000632142 ABCC8Q09428 1581 aa35.69■■■■□ 3.3
ESPN-211ENST00000632142 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.61■■■■□ 3.29
ESPN-211ENST00000632142 IFT140Q96RY7 1462 aa35.57■■■■□ 3.28
ESPN-211ENST00000632142 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.27
ESPN-211ENST00000632142 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
ESPN-211ENST00000632142 CUX1P39880 1505 aa35.42■■■■□ 3.26
ESPN-211ENST00000632142 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.36■■■■□ 3.25
ESPN-211ENST00000632142 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
ESPN-211ENST00000632142 SOGA1O94964 1423 aa35.36■■■■□ 3.25
ESPN-211ENST00000632142 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.31■■■■□ 3.247e-15■□□□□ 10.4
ESPN-211ENST00000632142 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.3■■■■□ 3.24
ESPN-211ENST00000632142 OSCARQ8IYS5 282 aa35.26■■■■□ 3.24
ESPN-211ENST00000632142 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
ESPN-211ENST00000632142 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
ESPN-211ENST00000632142 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.1■■■■□ 3.21
ESPN-211ENST00000632142 SYNJ1O43426 1573 aa34.99■■■■□ 3.19
ESPN-211ENST00000632142 TOP2BQ02880 1626 aa34.98■■■■□ 3.19
ESPN-211ENST00000632142 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.96■■■■□ 3.19
ESPN-211ENST00000632142 WDR97A6NE52 1622 aa34.93■■■■□ 3.18
ESPN-211ENST00000632142 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.92■■■■□ 3.18
ESPN-211ENST00000632142 FBLN2P98095 1184 aa34.91■■■■□ 3.18
ESPN-211ENST00000632142 GRIN2BQ13224 1484 aa34.9■■■■□ 3.18
ESPN-211ENST00000632142 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.88■■■■□ 3.17
ESPN-211ENST00000632142 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.86■■■■□ 3.17
ESPN-211ENST00000632142 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
ESPN-211ENST00000632142 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
ESPN-211ENST00000632142 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.76■■■■□ 3.15
ESPN-211ENST00000632142 CHD1O14646 1710 aa34.72■■■■□ 3.15
ESPN-211ENST00000632142 SYNJ2O15056 1496 aa34.69■■■■□ 3.14
ESPN-211ENST00000632142 TRIM41Q8WV44 630 aa34.64■■■■□ 3.14
ESPN-211ENST00000632142 PBRM1Q86U86 1689 aa34.62■■■■□ 3.13
ESPN-211ENST00000632142 ARHGEF11O15085 1522 aa34.54■■■■□ 3.12
ESPN-211ENST00000632142 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.52■■■■□ 3.12
ESPN-211ENST00000632142 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.52■■■■□ 3.12
ESPN-211ENST00000632142 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.52■■■■□ 3.12
ESPN-211ENST00000632142 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.5■■■■□ 3.11
ESPN-211ENST00000632142 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.48■■■■□ 3.11
ESPN-211ENST00000632142 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.48■■■■□ 3.11
ESPN-211ENST00000632142 GRIN2AQ12879 1464 aa34.44■■■■□ 3.1
ESPN-211ENST00000632142 IGF1RP08069 1367 aa34.43■■■■□ 3.1
ESPN-211ENST00000632142 ADAMTS12P58397 1594 aa34.42■■■■□ 3.1
ESPN-211ENST00000632142 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.4■■■■□ 3.1
ESPN-211ENST00000632142 KIF27Q86VH2 1401 aa34.37■■■■□ 3.09
ESPN-211ENST00000632142 NUP160Q12769 1436 aa34.35■■■■□ 3.09
ESPN-211ENST00000632142 ARAP1Q96P48 1450 aa34.28■■■■□ 3.08
ESPN-211ENST00000632142 CEP170Q5SW79 1584 aa34.26■■■■□ 3.07
ESPN-211ENST00000632142 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.14■■■■□ 3.06
ESPN-211ENST00000632142 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.13■■■■□ 3.05
ESPN-211ENST00000632142 JPH4Q96JJ6 628 aa34.11■■■■□ 3.05
ESPN-211ENST00000632142 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.06■■■■□ 3.04
ESPN-211ENST00000632142 CUL7Q14999 1698 aa34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 174.4 ms