RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555039.1

CKB-211, Transcript of creatine kinase B, humanhuman

TSL 5

Gene CKB, Length 270 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKB-211ENST00000555039 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.02■■■■□ 3.04
CKB-211ENST00000555039 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.01■■■□□ 2.39
CKB-211ENST00000555039 ABCC9O60706 1549 aa28.54■■■□□ 2.16
CKB-211ENST00000555039 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CKB-211ENST00000555039 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.31■■■□□ 2.12
CKB-211ENST00000555039 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.22■■■□□ 2.11
CKB-211ENST00000555039 NACADO15069 1562 aa28.07■■■□□ 2.08
CKB-211ENST00000555039 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.98■■■□□ 2.07
CKB-211ENST00000555039 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.9■■■□□ 2.06
CKB-211ENST00000555039 SCRIBQ14160 1630 aa27.28■■□□□ 1.96
CKB-211ENST00000555039 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.16■■□□□ 1.94
CKB-211ENST00000555039 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.07■■□□□ 1.92
CKB-211ENST00000555039 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.95■■□□□ 1.9
CKB-211ENST00000555039 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.873e-6■■□□□ 13.3
CKB-211ENST00000555039 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CKB-211ENST00000555039 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.32■■□□□ 1.8
CKB-211ENST00000555039 SMARCA4P51532 1647 aa26.24■■□□□ 1.79
CKB-211ENST00000555039 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CKB-211ENST00000555039 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.16■■□□□ 1.78
CKB-211ENST00000555039 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CKB-211ENST00000555039 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.06■■□□□ 1.76
CKB-211ENST00000555039 SMARCA2P51531 1590 aa26■■□□□ 1.75
CKB-211ENST00000555039 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.93■■□□□ 1.74
CKB-211ENST00000555039 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.9■■□□□ 1.74
CKB-211ENST00000555039 WIZO95785 1651 aa25.88■■□□□ 1.73
CKB-211ENST00000555039 NCAPD3P42695 1498 aa25.88■■□□□ 1.73
CKB-211ENST00000555039 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CKB-211ENST00000555039 HMGXB3Q12766 1538 aa25.83■■□□□ 1.72
CKB-211ENST00000555039 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CKB-211ENST00000555039 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CKB-211ENST00000555039 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.53■■□□□ 1.68
CKB-211ENST00000555039 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.4■■□□□ 1.66
CKB-211ENST00000555039 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.13■■□□□ 1.61
CKB-211ENST00000555039 CFTRP13569 1480 aa25.13■■□□□ 1.61
CKB-211ENST00000555039 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.08■■□□□ 1.61
CKB-211ENST00000555039 PRDM2Q13029 1718 aa24.98■■□□□ 1.59
CKB-211ENST00000555039 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.9■■□□□ 1.58
CKB-211ENST00000555039 NESP48681 1621 aa24.87■■□□□ 1.57
CKB-211ENST00000555039 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.8■■□□□ 1.56
CKB-211ENST00000555039 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.73■■□□□ 1.55
CKB-211ENST00000555039 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
CKB-211ENST00000555039 ABCC8Q09428 1581 aa24.64■■□□□ 1.54
CKB-211ENST00000555039 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.63■■□□□ 1.53
CKB-211ENST00000555039 ERCC6Q03468 1493 aa24.62■■□□□ 1.53
CKB-211ENST00000555039 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.61■■□□□ 1.53
CKB-211ENST00000555039 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.56■■□□□ 1.52
CKB-211ENST00000555039 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.54■■□□□ 1.52
CKB-211ENST00000555039 TOP2BQ02880 1626 aa24.54■■□□□ 1.52
CKB-211ENST00000555039 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.53■■□□□ 1.52
CKB-211ENST00000555039 CUX1P39880 1505 aa24.51■■□□□ 1.51
CKB-211ENST00000555039 TRIM41Q8WV44 630 aa24.5■■□□□ 1.51
CKB-211ENST00000555039 SYNJ1O43426 1573 aa24.49■■□□□ 1.51
CKB-211ENST00000555039 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CKB-211ENST00000555039 TOPBP1Q92547 1522 aa24.48■■□□□ 1.51
CKB-211ENST00000555039 WDR62O43379 1518 aa24.46■■□□□ 1.51
CKB-211ENST00000555039 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CKB-211ENST00000555039 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.33■■□□□ 1.49
CKB-211ENST00000555039 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CKB-211ENST00000555039 SOGA1O94964 1423 aa24.24■■□□□ 1.47
CKB-211ENST00000555039 IFT140Q96RY7 1462 aa24.22■■□□□ 1.47
CKB-211ENST00000555039 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.21■■□□□ 1.47
CKB-211ENST00000555039 CUX2O14529 1486 aa24.21■■□□□ 1.47
CKB-211ENST00000555039 EEA1Q15075 1411 aa24.19■■□□□ 1.46
CKB-211ENST00000555039 WDR97A6NE52 1622 aa24.17■■□□□ 1.46
CKB-211ENST00000555039 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CKB-211ENST00000555039 KIF27Q86VH2 1401 aa24.13■■□□□ 1.45
CKB-211ENST00000555039 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.13■■□□□ 1.45
CKB-211ENST00000555039 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.01■■□□□ 1.43
CKB-211ENST00000555039 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.98■■□□□ 1.43
CKB-211ENST00000555039 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
CKB-211ENST00000555039 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.94■■□□□ 1.42
CKB-211ENST00000555039 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.94■■□□□ 1.42
CKB-211ENST00000555039 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.94■■□□□ 1.42
CKB-211ENST00000555039 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CKB-211ENST00000555039 GRIN2BQ13224 1484 aa23.91■■□□□ 1.42
CKB-211ENST00000555039 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CKB-211ENST00000555039 IGF1RP08069 1367 aa23.9■■□□□ 1.42
CKB-211ENST00000555039 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.88■■□□□ 1.412e-8■■■■□ 21.7
CKB-211ENST00000555039 CUL7Q14999 1698 aa23.85■■□□□ 1.41
CKB-211ENST00000555039 PBRM1Q86U86 1689 aa23.84■■□□□ 1.41
CKB-211ENST00000555039 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CKB-211ENST00000555039 PRXQ9BXM0 1461 aa23.81■■□□□ 1.4
CKB-211ENST00000555039 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CKB-211ENST00000555039 KIF21BO75037 1637 aa23.81■■□□□ 1.4
CKB-211ENST00000555039 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.78■■□□□ 1.4
CKB-211ENST00000555039 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.76■■□□□ 1.39
CKB-211ENST00000555039 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.73■■□□□ 1.39
CKB-211ENST00000555039 ADAMTS12P58397 1594 aa23.73■■□□□ 1.39
CKB-211ENST00000555039 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.72■■□□□ 1.39
CKB-211ENST00000555039 GOLGA3Q08378 1498 aa23.71■■□□□ 1.39
CKB-211ENST00000555039 SYNJ2O15056 1496 aa23.68■■□□□ 1.38
CKB-211ENST00000555039 GRIN2AQ12879 1464 aa23.58■■□□□ 1.37
CKB-211ENST00000555039 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CKB-211ENST00000555039 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.55■■□□□ 1.36
CKB-211ENST00000555039 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CKB-211ENST00000555039 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.49■■□□□ 1.35
CKB-211ENST00000555039 NUP160Q12769 1436 aa23.48■■□□□ 1.35
CKB-211ENST00000555039 CHD1O14646 1710 aa23.45■■□□□ 1.34
CKB-211ENST00000555039 FBLN2P98095 1184 aa23.43■■□□□ 1.34
CKB-211ENST00000555039 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.43■■□□□ 1.34
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