Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNC2Q96PR1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNC2Q96PR1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNC2Q96PR1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC2Q96PR1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms