Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAVIN3Q969G5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CAVIN3Q969G5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN3Q969G5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN3Q969G5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN3Q969G5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN3Q969G5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN3Q969G5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN3Q969G5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN3Q969G5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN3Q969G5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN3Q969G5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN3Q969G5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN3Q969G5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN3Q969G5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN3Q969G5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN3Q969G5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN3Q969G5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms