Protein–RNA interactions for Protein: Q92979

EMG1, Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMG1Q92979 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMG1Q92979 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMG1Q92979 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMG1Q92979 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMG1Q92979 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMG1Q92979 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMG1Q92979 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms