Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP3S1Q92572 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3S1Q92572 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms