Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC71LQ8N9Z2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC71LQ8N9Z2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC71LQ8N9Z2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms