Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREML1Q86YW5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREML1Q86YW5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TREML1Q86YW5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TREML1Q86YW5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms