Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX8Q7RTT4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX8Q7RTT4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX8Q7RTT4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX8Q7RTT4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX8Q7RTT4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX8Q7RTT4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX8Q7RTT4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX8Q7RTT4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX8Q7RTT4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX8Q7RTT4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX8Q7RTT4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSX8Q7RTT4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX8Q7RTT4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX8Q7RTT4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms