Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF3Q5VWG9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAF3Q5VWG9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF3Q5VWG9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms