Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMCO4Q5TGY1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCO4Q5TGY1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMCO4Q5TGY1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCO4Q5TGY1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO4Q5TGY1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO4Q5TGY1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO4Q5TGY1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCO4Q5TGY1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms