Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA76

LCE3A, Late cornified envelope protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3AQ5TA76 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LCE3AQ5TA76 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LCE3AQ5TA76 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LCE3AQ5TA76 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LCE3AQ5TA76 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LCE3AQ5TA76 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LCE3AQ5TA76 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LCE3AQ5TA76 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LCE3AQ5TA76 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LCE3AQ5TA76 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LCE3AQ5TA76 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LCE3AQ5TA76 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LCE3AQ5TA76 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LCE3AQ5TA76 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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