Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBAP2Q5T6F2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBAP2Q5T6F2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBAP2Q5T6F2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBAP2Q5T6F2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAP2Q5T6F2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms