Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMM50Q3ZCQ8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMM50Q3ZCQ8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMM50Q3ZCQ8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms