Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBFBQ13951 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBFBQ13951 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFBQ13951 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFBQ13951 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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