Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPBGQ13641 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPBGQ13641 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TPBGQ13641 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPBGQ13641 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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