Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ID3Q02535 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ID3Q02535 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ID3Q02535 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ID3Q02535 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ID3Q02535 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ID3Q02535 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ID3Q02535 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ID3Q02535 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ID3Q02535 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ID3Q02535 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ID3Q02535 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ID3Q02535 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ID3Q02535 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ID3Q02535 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ID3Q02535 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ID3Q02535 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ID3Q02535 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ID3Q02535 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ID3Q02535 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ID3Q02535 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ID3Q02535 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ID3Q02535 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ID3Q02535 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ID3Q02535 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ID3Q02535 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ID3Q02535 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ID3Q02535 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ID3Q02535 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ID3Q02535 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ID3Q02535 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ID3Q02535 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ID3Q02535 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ID3Q02535 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ID3Q02535 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ID3Q02535 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ID3Q02535 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ID3Q02535 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ID3Q02535 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ID3Q02535 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ID3Q02535 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ID3Q02535 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ID3Q02535 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ID3Q02535 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ID3Q02535 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ID3Q02535 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ID3Q02535 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ID3Q02535 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ID3Q02535 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ID3Q02535 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ID3Q02535 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ID3Q02535 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ID3Q02535 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ID3Q02535 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ID3Q02535 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ID3Q02535 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ID3Q02535 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ID3Q02535 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ID3Q02535 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ID3Q02535 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ID3Q02535 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ID3Q02535 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ID3Q02535 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ID3Q02535 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ID3Q02535 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ID3Q02535 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ID3Q02535 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ID3Q02535 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ID3Q02535 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ID3Q02535 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ID3Q02535 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ID3Q02535 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ID3Q02535 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ID3Q02535 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ID3Q02535 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ID3Q02535 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ID3Q02535 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ID3Q02535 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ID3Q02535 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ID3Q02535 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ID3Q02535 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ID3Q02535 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ID3Q02535 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ID3Q02535 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ID3Q02535 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ID3Q02535 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ID3Q02535 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ID3Q02535 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ID3Q02535 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ID3Q02535 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ID3Q02535 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ID3Q02535 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ID3Q02535 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ID3Q02535 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ID3Q02535 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ID3Q02535 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ID3Q02535 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ID3Q02535 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ID3Q02535 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ID3Q02535 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms