Protein–RNA interactions for Protein: P51608

MECP2, Methyl-CpG-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MECP2P51608 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MECP2P51608 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MECP2P51608 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MECP2P51608 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MECP2P51608 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MECP2P51608 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MECP2P51608 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MECP2P51608 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MECP2P51608 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MECP2P51608 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MECP2P51608 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MECP2P51608 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MECP2P51608 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MECP2P51608 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MECP2P51608 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MECP2P51608 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MECP2P51608 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MECP2P51608 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MECP2P51608 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MECP2P51608 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MECP2P51608 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MECP2P51608 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MECP2P51608 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MECP2P51608 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MECP2P51608 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MECP2P51608 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MECP2P51608 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MECP2P51608 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MECP2P51608 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MECP2P51608 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MECP2P51608 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MECP2P51608 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MECP2P51608 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MECP2P51608 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MECP2P51608 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MECP2P51608 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MECP2P51608 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MECP2P51608 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MECP2P51608 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MECP2P51608 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MECP2P51608 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MECP2P51608 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MECP2P51608 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MECP2P51608 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MECP2P51608 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MECP2P51608 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MECP2P51608 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MECP2P51608 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MECP2P51608 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MECP2P51608 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MECP2P51608 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MECP2P51608 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MECP2P51608 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MECP2P51608 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MECP2P51608 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MECP2P51608 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MECP2P51608 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MECP2P51608 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MECP2P51608 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MECP2P51608 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MECP2P51608 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MECP2P51608 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MECP2P51608 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MECP2P51608 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MECP2P51608 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MECP2P51608 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MECP2P51608 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MECP2P51608 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MECP2P51608 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MECP2P51608 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MECP2P51608 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MECP2P51608 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MECP2P51608 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MECP2P51608 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MECP2P51608 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MECP2P51608 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MECP2P51608 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MECP2P51608 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MECP2P51608 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MECP2P51608 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MECP2P51608 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MECP2P51608 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MECP2P51608 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MECP2P51608 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MECP2P51608 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MECP2P51608 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MECP2P51608 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MECP2P51608 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MECP2P51608 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MECP2P51608 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MECP2P51608 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MECP2P51608 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MECP2P51608 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MECP2P51608 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MECP2P51608 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MECP2P51608 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MECP2P51608 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MECP2P51608 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MECP2P51608 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MECP2P51608 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms