Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX6P35712 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX6P35712 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX6P35712 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX6P35712 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX6P35712 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX6P35712 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX6P35712 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX6P35712 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX6P35712 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX6P35712 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX6P35712 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX6P35712 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX6P35712 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX6P35712 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX6P35712 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX6P35712 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX6P35712 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX6P35712 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX6P35712 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX6P35712 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX6P35712 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX6P35712 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX6P35712 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX6P35712 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX6P35712 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX6P35712 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX6P35712 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX6P35712 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX6P35712 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX6P35712 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX6P35712 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX6P35712 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX6P35712 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX6P35712 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX6P35712 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX6P35712 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX6P35712 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX6P35712 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX6P35712 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX6P35712 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX6P35712 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX6P35712 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX6P35712 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX6P35712 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX6P35712 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX6P35712 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX6P35712 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX6P35712 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX6P35712 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX6P35712 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX6P35712 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX6P35712 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX6P35712 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX6P35712 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX6P35712 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX6P35712 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX6P35712 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX6P35712 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX6P35712 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX6P35712 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX6P35712 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX6P35712 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX6P35712 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX6P35712 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX6P35712 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX6P35712 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX6P35712 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX6P35712 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX6P35712 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX6P35712 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX6P35712 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX6P35712 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX6P35712 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX6P35712 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX6P35712 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX6P35712 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX6P35712 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX6P35712 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX6P35712 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX6P35712 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX6P35712 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX6P35712 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX6P35712 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX6P35712 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX6P35712 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX6P35712 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX6P35712 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX6P35712 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX6P35712 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX6P35712 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX6P35712 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX6P35712 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX6P35712 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX6P35712 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX6P35712 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX6P35712 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX6P35712 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX6P35712 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX6P35712 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms